孙飞 教授、博士生导师
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办公地点：东南大学江北校区汇川楼B207
个人简介：
孙飞，东南大学生命科学与技术学院教授、博士生导师、副院长，东南大学仲英青年学者。2009年毕业于山东大学生命科学学院，获学士学位；2014年毕业于中国科学院微生物研究所，获博士学位；2014-2021年在美国加州大学洛杉矶分校（UCLA）担任博士后研究员和助理项目科学家；2022年加入东南大学生命科学与技术学院。
研究方向：三维基因组与基因调控
以Hi-C为代表的染色体构象捕获技术的发展使人们对基因组的认识进入了3D水平。利用三维基因组技术重建的染色质互作图谱显示，染色体在不同层次上形成各式各样的三维结构。这些结构的紊乱虽然不会直接造成基因缺陷，但会使基因的表达产生异常并可能导致癌症等一系列疾病的发生。本课题组以小鼠胚胎干细胞或癌细胞为模式生物，利用多组学手段，结合生物信息学，深入研究染色体三维结构的功能和转录调控的机理，具体研究内容包括：（1）三维基因组与转录调控和致癌突变之间的相互关系；（2）反式作用因子（如RNA聚合酶及各种转录因子）在基因调控和癌症发生过程中的功能；（3）新型组学方法和生物信息学分析工具的开发。
代表性论文：
1. Sun F, Sun T, Kronenberg M, Tan X, Huang C, Carey MF. (2021) The Pol II preinitiation complex (PIC) influences Mediator binding but not promoter-enhancer looping. Genes & Development, 35(15-16): 1175-1189.
2. Sun F, Chronis C, Kronenberg M, Chen XF, Su T, Lay FD, Plath K, Kurdistani S, Carey MF. (2019) Promoter-enhancer communication occurs primarily within insulated neighborhoods. Molecular Cell, 73(2): 250-263.
3. Xue Y#, Pradhan S#, Sun F#, Chronis K, Tran N, Van C, Vashisht A, Wohlschlegel J, Peterson CL, Timmers HTM, Kurdistani SK, Carey MF. (2017) Mot1, Ino80C and NC2 function coordinately to regulate pervasive transcription in yeast and mammals. Molecular Cell, 67(4): 594-607. (#并列第一作者)
4. Sun F, Huang L. (2016) A euryarchaeal histone modulates strand displacement synthesis by replicative DNA polymerases. Science China Life Sciences, 59(7): 709-716.
5. Sun F, Huang L. (2013) Sulfolobus chromatin proteins modulate strand displacement by DNA Polymerase B1. Nucleic Acids Research, 41(17): 8182-95
6. Feng AC, Thomas BJ, Purbey PK, de Melo FM, Liu X, Daly AE, Sun F, Lo JH, Cheng L, Carey MF, Scumpia PO, Smale ST. (2024) The transcription factor NF-κB orchestrates nucleosome remodeling during the primary response to Toll-like receptor 4 signaling. Immunity, 57(3):462-477
7. Liu Q, Bischof S, Harris CJ, Zhong Z, Zhan L, Nguyen C, Rashoff A, Barshop WD, Sun F, Feng S, Potok M, Gallego-Bartolome J, Zhai J, Wohlschlegel JA, Carey MF, Long JA, Jacobsen SE. (2020) The characterization of Mediator 12 and 13 as conditional positive gene regulators in Arabidopsis. Nature Communications, 11(1):2798
