遗传信息的表达始于转录。在后生动物中，RNA聚合酶II（Pol II）介导的mRNA转录在多个阶段受到复杂的调控，以确保基因表达的精确性。Pol II在启动子近端暂停的建立及释放是早期转录延伸的关键调控步骤。正向转录延伸因子（P-TEFb）是Pol II从暂停到释放至有效延伸阶段转变的关键调控因子。在转录信号刺激下，P-TEFb从非活性复合物中释放出来，进入活性超级延伸复合物（SEC），从而激活转录。林承棋、罗卓娟教授之前研究鉴定并发现，SEC是后生动物中调控基因转录的重要复合物，与早期胚胎发育及机体应激反应等生理活动密切相关。SEC各亚基的突变与多种不同的人类疾病相关，但其具体分子作用机制，特别在转录调控功能方面的差异，尚不明确。
2023年8月1日，东南大学生命科学与技术学院林承棋教授和罗卓娟教授团队在国际知名学术期刊Journal of Molecular Cell Biology在线发表了题为“Distinct roles of the two SEC scaffold proteins, AFF1 and AFF4, in regulating RNA Pol II transcription elongation” 的研究工作。报道了超级转录延伸复合物（SEC）的两个支架蛋白AFF1和AFF4在基因组上的定位差异，并揭示它们可分别在转录的不同阶段调控RNA聚合酶II的转录起始与延伸。
该工作描绘了AFF1和AFF4在基因组上的差异性分布。通过基因组学定位分析发现AFF1主要结合在转录起始位点TSS的上游，而AFF4在TSS的下游富集。AFF1和AFF4功能缺失都会导致转录延伸速率改变。有趣的是，AFF4敲除导致一部分AFF4结合的活跃基因上转录延伸速率变慢并且转录终止提前，而AFF1的缺失则会导致该类基因上的转录延伸速率变快且转录通读。此外，AFF1的缺失还会导致染色质上AFF4结合水平的增加，反之亦然。综上所述，该研究揭示了SEC的两个支架蛋白AFF1和AFF4在调控Pol II转录中分别发挥不同、一定程度上相互拮抗的转录调控作用。
图1.作用模式图
东南大学生命科学与技术学院林承棋教授和罗卓娟教授为该论文的共同通讯作者。东南大学生命科学与技术学院博士生车转转、博士生刘晓旭、戴倩博士（现在安徽医科大学）为该论文的共同第一作者。该工作得到了科技部国家重点研发计划 (2018YFA0800100、2018YFA0800103) ;国家自然科学基金 (32030017、31970617、31970626) ;深圳市科技计划 (JCYJ20210324133602008、JCYJ20210324133601005)等项目的资助。（生科院）
